法律分析：公司有诉讼的，一般不可以注销。公司要经依法清算后，才能向公司登记机关申请办理注销登记。所以在公司进行诉讼时，权利义务关系尚未明确，公司的清算组也不能准确的确定公司的资产和债权债务情况，暂时不能进行注销。
一、公司办理注销需要的手续有：
1、成立清算组，制定清算方案并报确认；
2、以清算财产支付各种税、费、债；
3、制定清算报告并报股东会、股东大会或人民确认；
4、办理注销登记、注销营业执照。
二、公司注销的办理流程为：
1、办理国税注销税务登记；
2、办理地税注销税务登记；
3、到开户银行办理银行账户销户；
4、到公司主管工商局办理公司注销备案；
5、刊登注销公告；
6、登报45日后，再次到工商局办理注销申请；
7、到质监局注销代码证。
总而言之，公司在清算期间被起诉的，在案件结束前，不能注销公司。但是在诉讼过程中，公司未经清算即办理注销登记的，则应当由有限责任公司的股东在债权人主张的公司债务范围内，承担相应的赔偿责任，当然赔偿的前提是债权债务查证属实。在民事诉讼过程中，作为一方当事人的公司办理注销登记的，应当区分注销公司时依法清算和未清算两种情形。如果在当事人起诉后，公司依法成立了清算组，依照公司法等规定进行了清算，则诉讼应当中止或者终止，当事人可以依照公司清算程序实现自身权利。
一、有限公司有欠款的能否注销
公司注销需要先清算，清算结束后才能办理注销登记。所以如果有欠款的，无法进行注销。但是破产清算除外。
《中华人民共和国公司法》
第一百八十六条【清算程序】清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，应当制定清算方案，并报股东会、股东大会或者人民确认。
公司财产在分别支付清算费用、职工的工资、社会保险费用和法定补偿金，缴纳所欠税款，清偿公司债务后的剩余财产，有限责任公司按照股东的出资比例分配，股份有限公司按照股东持有的股份比例分配。
清算期间，公司存续，但不得开展与清算无关的经营活动。公司财产在未依照前款规定清偿前，不得分配给股东。
第一百八十【公司注销】公司清算结束后，清算组应当制作清算报告，报股东会、股东大会或者人民确认，并报送公司登记机关，申请注销公司登记，公告公司终止。
法律依据：《中华人民共和国公司法》第一百八十、一百八十三、一百八十四条规定：因公司章程规定的营业期限届满或公司章程规定的其他解散事由出现或股东会、股东大会决议解散或依法被吊销营业执照、责令关闭或被插销等情况的，公司应当成立清算组进行清算。
